嵌入式工控机使用的操作系统有linux以及windows。嵌入式工控机使用windows的特点，Windows的应用，更多的技术人员的应用和软件开发，使PC机的软件极为丰富。PC机功能已经很强，CAD/CAM的软件已大量由小型机，工作站向PC机移植，三维图形显示工艺数据已经在PC机上建立。嵌入式工控机操作系统linuxlinux的特点，是没有友好的图形界面，但是系统稳定性、安全性都高于Windows系统。